ตามข้อสั่งการของนายกรัฐมนตรี ให้ผู้ว่าราชการจังหวัดเป็นหน่วยงานหลักในการประสานและให้ความช่วยเหลือประชาชนที่ได้รับผลกระทบจากสถานการณ์อุทกภัย พร้อมให้ทุกหน่วยงานสนับสนุนการช่วยเหลืออย่างเต็มกำลัง กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม (ทส.) โดยนายสุชาติ ชมกลิ่น รัฐมนตรีว่าการกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม ได้สั่งการหน่วยงานในสังกัดระดมกำลังเจ้าหน้าที่ เครื่องสูบน้ำ เครื่องจักร เรือ อากาศยาน และอุปกรณ์ที่จำเป็น สนับสนุนจังหวัดในการประเมินสถานการณ์ เร่งระบายน้ำ ช่วยเหลือประชาชน และดูแลสัตว์ป่าที่ได้รับผลกระทบจากอุทกภัยอย่างต่อเนื่อง

สำนักงานปลัดกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม สนับสนุนเฮลิคอปเตอร์ จำนวน 4 ลำ สำหรับสนับสนุนภารกิจของจังหวัดในการประเมินและติดตามสถานการณ์อุทกภัย แบ่งเป็นพื้นที่ภาคตะวันออก 2 ลำ และพื้นที่ภาคเหนือตอนล่างและภาคกลางตอนบน 2 ลำ เพื่อสำรวจสถานการณ์น้ำ พื้นที่ประสบภัย และสนับสนุนข้อมูลประกอบการวางแผนช่วยเหลือประชาชนได้อย่างเหมาะสมและทันท่วงที

กรมทรัพยากรน้ำ ระดมเครื่องสูบน้ำเข้าช่วยเหลือพื้นที่ประสบอุทกภัย โดย ติดตั้งเครื่องสูบน้ำในจังหวัดสระบุรี ปทุมธานี และนครสวรรค์ ได้แก่ จังหวัดสระบุรี ติดตั้งเครื่องสูบน้ำขนาด 24 นิ้ว จำนวน 1 เครื่อง บริเวณท่อลอด เขตเทศบาลหนองแค เพื่อสูบระบายน้ำลงคลองสาขาคลองระพีพัฒน์ จังหวัดปทุมธานี ติดตั้งเครื่องสูบน้ำขนาด 30 นิ้ว จำนวน 1 เครื่อง บริเวณคลองสามวา อำเภอลาดหลุมแก้ว เพื่อช่วยเหลือประชาชน 2 ตำบล รวมประมาณ 900 หลังคาเรือน หรือประมาณ 10,000 คน และจังหวัดนครสวรรค์ ติดตั้งเครื่องสูบน้ำขนาด 16 นิ้ว จำนวน 1 เครื่อง บริเวณบ้านหัวโปร่ง อำเภอโกรกพระ เพื่อเร่งระบายน้ำออกจากพื้นที่การเกษตรนาข้าวกว่า 2,000 ไร่ ช่วยเหลือประชาชนประมาณ 60 หลังคาเรือน หรือ 240 คน

พื้นที่จังหวัดปราจีนบุรี เร่งติดตั้งเครื่องสูบน้ำขนาด 12 นิ้ว ณ โรงพยาบาลเจ้าพระยาอภัยภูเบศร อำเภอเมืองปราจีนบุรี เพื่อเร่งระบายน้ำที่ไหลเข้าท่วมพื้นที่โรงพยาบาล และติดตั้งเครื่องสูบน้ำไฮดรอลิกขนาด 24 นิ้ว จำนวน 1 เครื่อง ณ ประตูระบายน้ำบางแตน อำเภอบ้านสร้าง เพื่อเร่งผลักดันน้ำลงสู่แม่น้ำบางปะกง

กรมทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่ง ระดมกำลังสนับสนุนการช่วยเหลือประชาชนในพื้นที่ภาคตะวันออก ได้แก่ จังหวัดชลบุรี ระยอง จันทบุรี และตราด โดยจังหวัดชลบุรี มอบถุงยังชีพและน้ำดื่มกว่า 200 ชุด ให้แก่ประชาชนในพื้นที่ตำบลห้วยกะปิ พร้อมร่วมสำรวจสถานการณ์ เคลื่อนย้ายผู้ป่วยและผู้สูงอายุ รวมถึงขนส่งสิ่งของจำเป็นในพื้นที่อำเภอพานทองและพนัสนิคม ส่วนจังหวัดจันทบุรีและตราด จัดเตรียมเรือยาง 3 ลำ เสื้อชูชีพ 30 ตัว และอุปกรณ์จำเป็น เพื่อสนับสนุนภารกิจช่วยเหลือประชาชนในพื้นที่เสี่ยง ขณะที่จังหวัดระยอง ส่งเจ้าหน้าที่ 4 นาย พร้อมรถยนต์ขับเคลื่อน 4 ล้อ เข้าช่วยเหลือประชาชนในพื้นที่ตำบลบ้านเพ จำนวน 20 หลังคาเรือน โดยช่วยเคลื่อนย้ายสิ่งของขึ้นที่สูงเพื่อป้องกันความเสียหาย 

กรมอุทยานแห่งชาติ สัตว์ป่า และพันธุ์พืช โดยกองอนุรักษ์สัตว์ป่า ระดมทีมสัตวแพทย์และเจ้าหน้าที่ รวม 20 คน ร่วมกับมูลนิธิเพื่อนสัตว์ป่า อาสาสมัครสัตวแพทย์ องค์การสวนสัตว์ และมูลนิธิ Little Paws ลงพื้นที่สยามอะเมซิ่งพาร์ค เมื่อวันที่ 27 กันยายน 2569 เพื่อประเมินสถานการณ์และช่วยเหลือสัตว์ป่าที่ได้รับผลกระทบจากน้ำท่วม โดยสามารถเคลื่อนย้ายเนื้อทรายได้ 10 ตัว และพบซากเนื้อทราย 6 ซาก ซึ่งเสียชีวิตก่อนเข้าดำเนินการ ภารกิจแล้วเสร็จเมื่อเวลา 23.30 น.

นอกจากนี้ เมื่อวันที่ 28 กันยายน 2569 หน่วยงานในสังกัดได้สนับสนุนเรือยางและเรือท้องแบนจำนวน 10 ลำ พร้อมรถครัวสนามเคลื่อนที่พร้อมเจ้าหน้าที่ ลงพื้นที่ ณ ศูนย์ประสานงานสถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง (สจล.) เขตลาดกระบัง กรุงเทพมหานคร ประกอบอาหารเช้าเป็นข้าวกล่อง จำนวน 20,000 กล่อง ต่อมื้อ โดยส่งมอบให้ประชาชนภายในศูนย์พักพิง และจัดเตรียมแจกจ่ายแก่ประชาชนภายนอกศูนย์พักพิงด้วย

กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม ยังคงติดตามสถานการณ์น้ำและอุทกภัยอย่างใกล้ชิด พร้อมบูรณาการหน่วยงานในสังกัด ระดมกำลังเจ้าหน้าที่ เครื่องมือ เครื่องจักร อากาศยาน และอุปกรณ์ที่จำเป็น สนับสนุนจังหวัดในการประเมินสถานการณ์ เร่งระบายน้ำ ช่วยเหลือและบรรเทาความเดือดร้อนของประชาชน ดูแลสัตว์ป่าที่ได้รับผลกระทบ และลดผลกระทบจากสถานการณ์อุทกภัยในพื้นที่ต่าง ๆ อย่างต่อเนื่อง